Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd4P10628 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Hoxd4P10628 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd4P10628 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd4P10628 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd4P10628 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd4P10628 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd4P10628 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd4P10628 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd4P10628 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd4P10628 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd4P10628 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd4P10628 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd4P10628 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd4P10628 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd4P10628 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd4P10628 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd4P10628 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd4P10628 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd4P10628 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd4P10628 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd4P10628 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd4P10628 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd4P10628 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd4P10628 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd4P10628 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd4P10628 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd4P10628 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd4P10628 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd4P10628 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd4P10628 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd4P10628 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd4P10628 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd4P10628 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd4P10628 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd4P10628 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd4P10628 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd4P10628 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd4P10628 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd4P10628 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd4P10628 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd4P10628 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd4P10628 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd4P10628 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd4P10628 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd4P10628 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd4P10628 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd4P10628 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd4P10628 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd4P10628 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd4P10628 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd4P10628 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd4P10628 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd4P10628 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd4P10628 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd4P10628 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd4P10628 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd4P10628 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd4P10628 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd4P10628 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd4P10628 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd4P10628 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd4P10628 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd4P10628 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hoxd4P10628 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hoxd4P10628 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms