Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnmt3cP0DOY1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnmt3cP0DOY1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnmt3cP0DOY1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnmt3cP0DOY1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnmt3cP0DOY1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnmt3cP0DOY1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnmt3cP0DOY1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnmt3cP0DOY1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnmt3cP0DOY1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnmt3cP0DOY1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnmt3cP0DOY1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnmt3cP0DOY1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnmt3cP0DOY1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnmt3cP0DOY1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnmt3cP0DOY1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnmt3cP0DOY1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnmt3cP0DOY1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnmt3cP0DOY1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnmt3cP0DOY1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dnmt3cP0DOY1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dnmt3cP0DOY1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dnmt3cP0DOY1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dnmt3cP0DOY1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dnmt3cP0DOY1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dnmt3cP0DOY1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dnmt3cP0DOY1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dnmt3cP0DOY1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnmt3cP0DOY1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnmt3cP0DOY1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnmt3cP0DOY1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnmt3cP0DOY1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnmt3cP0DOY1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnmt3cP0DOY1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dnmt3cP0DOY1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dnmt3cP0DOY1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dnmt3cP0DOY1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dnmt3cP0DOY1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dnmt3cP0DOY1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dnmt3cP0DOY1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Dnmt3cP0DOY1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dnmt3cP0DOY1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dnmt3cP0DOY1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dnmt3cP0DOY1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dnmt3cP0DOY1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dnmt3cP0DOY1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dnmt3cP0DOY1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dnmt3cP0DOY1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dnmt3cP0DOY1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnmt3cP0DOY1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnmt3cP0DOY1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnmt3cP0DOY1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnmt3cP0DOY1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnmt3cP0DOY1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnmt3cP0DOY1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnmt3cP0DOY1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnmt3cP0DOY1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnmt3cP0DOY1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnmt3cP0DOY1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnmt3cP0DOY1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnmt3cP0DOY1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dnmt3cP0DOY1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dnmt3cP0DOY1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dnmt3cP0DOY1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dnmt3cP0DOY1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dnmt3cP0DOY1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dnmt3cP0DOY1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dnmt3cP0DOY1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dnmt3cP0DOY1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dnmt3cP0DOY1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dnmt3cP0DOY1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dnmt3cP0DOY1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dnmt3cP0DOY1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dnmt3cP0DOY1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dnmt3cP0DOY1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dnmt3cP0DOY1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dnmt3cP0DOY1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Dnmt3cP0DOY1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dnmt3cP0DOY1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dnmt3cP0DOY1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dnmt3cP0DOY1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dnmt3cP0DOY1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dnmt3cP0DOY1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dnmt3cP0DOY1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnmt3cP0DOY1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnmt3cP0DOY1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnmt3cP0DOY1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnmt3cP0DOY1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnmt3cP0DOY1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnmt3cP0DOY1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnmt3cP0DOY1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnmt3cP0DOY1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnmt3cP0DOY1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnmt3cP0DOY1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnmt3cP0DOY1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnmt3cP0DOY1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnmt3cP0DOY1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnmt3cP0DOY1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnmt3cP0DOY1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnmt3cP0DOY1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms