Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UbbP0CG49 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UbbP0CG49 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
UbbP0CG49 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UbbP0CG49 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UbbP0CG49 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UbbP0CG49 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UbbP0CG49 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UbbP0CG49 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UbbP0CG49 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UbbP0CG49 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UbbP0CG49 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UbbP0CG49 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UbbP0CG49 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UbbP0CG49 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UbbP0CG49 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UbbP0CG49 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UbbP0CG49 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UbbP0CG49 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UbbP0CG49 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UbbP0CG49 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UbbP0CG49 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UbbP0CG49 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UbbP0CG49 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UbbP0CG49 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UbbP0CG49 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UbbP0CG49 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UbbP0CG49 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
UbbP0CG49 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UbbP0CG49 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UbbP0CG49 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UbbP0CG49 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UbbP0CG49 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UbbP0CG49 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UbbP0CG49 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UbbP0CG49 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
UbbP0CG49 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UbbP0CG49 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UbbP0CG49 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UbbP0CG49 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UbbP0CG49 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UbbP0CG49 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UbbP0CG49 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UbbP0CG49 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
UbbP0CG49 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UbbP0CG49 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UbbP0CG49 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UbbP0CG49 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms