Protein–RNA interactions for Protein: P09633

Hoxc9, Homeobox protein Hox-C9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc9P09633 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Hoxc9P09633 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hoxc9P09633 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hoxc9P09633 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hoxc9P09633 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hoxc9P09633 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hoxc9P09633 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hoxc9P09633 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hoxc9P09633 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hoxc9P09633 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hoxc9P09633 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hoxc9P09633 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hoxc9P09633 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hoxc9P09633 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hoxc9P09633 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hoxc9P09633 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hoxc9P09633 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hoxc9P09633 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hoxc9P09633 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hoxc9P09633 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hoxc9P09633 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hoxc9P09633 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hoxc9P09633 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Hoxc9P09633 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hoxc9P09633 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hoxc9P09633 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hoxc9P09633 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hoxc9P09633 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Hoxc9P09633 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hoxc9P09633 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hoxc9P09633 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hoxc9P09633 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hoxc9P09633 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hoxc9P09633 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Hoxc9P09633 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hoxc9P09633 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Hoxc9P09633 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hoxc9P09633 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hoxc9P09633 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hoxc9P09633 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hoxc9P09633 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Hoxc9P09633 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hoxc9P09633 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hoxc9P09633 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hoxc9P09633 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hoxc9P09633 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hoxc9P09633 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hoxc9P09633 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hoxc9P09633 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hoxc9P09633 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hoxc9P09633 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hoxc9P09633 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hoxc9P09633 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hoxc9P09633 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Hoxc9P09633 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hoxc9P09633 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hoxc9P09633 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Hoxc9P09633 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hoxc9P09633 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hoxc9P09633 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hoxc9P09633 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Hoxc9P09633 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Hoxc9P09633 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Hoxc9P09633 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hoxc9P09633 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hoxc9P09633 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hoxc9P09633 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hoxc9P09633 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hoxc9P09633 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hoxc9P09633 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hoxc9P09633 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hoxc9P09633 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hoxc9P09633 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hoxc9P09633 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hoxc9P09633 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hoxc9P09633 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hoxc9P09633 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hoxc9P09633 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hoxc9P09633 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hoxc9P09633 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hoxc9P09633 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hoxc9P09633 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hoxc9P09633 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hoxc9P09633 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hoxc9P09633 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hoxc9P09633 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hoxc9P09633 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hoxc9P09633 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hoxc9P09633 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hoxc9P09633 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hoxc9P09633 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hoxc9P09633 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hoxc9P09633 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Hoxc9P09633 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hoxc9P09633 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hoxc9P09633 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hoxc9P09633 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hoxc9P09633 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hoxc9P09633 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hoxc9P09633 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms