Protein–RNA interactions for Protein: P08121

Col3a1, Collagen alpha-1(III) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col3a1P08121 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col3a1P08121 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Col3a1P08121 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Col3a1P08121 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Col3a1P08121 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Col3a1P08121 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Col3a1P08121 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Col3a1P08121 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Col3a1P08121 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Col3a1P08121 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Col3a1P08121 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Col3a1P08121 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col3a1P08121 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col3a1P08121 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col3a1P08121 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col3a1P08121 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Col3a1P08121 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col3a1P08121 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col3a1P08121 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col3a1P08121 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col3a1P08121 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col3a1P08121 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col3a1P08121 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col3a1P08121 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col3a1P08121 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Col3a1P08121 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col3a1P08121 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col3a1P08121 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col3a1P08121 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col3a1P08121 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col3a1P08121 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col3a1P08121 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col3a1P08121 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col3a1P08121 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col3a1P08121 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col3a1P08121 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col3a1P08121 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col3a1P08121 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col3a1P08121 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col3a1P08121 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col3a1P08121 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col3a1P08121 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Col3a1P08121 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col3a1P08121 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col3a1P08121 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col3a1P08121 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col3a1P08121 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col3a1P08121 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col3a1P08121 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col3a1P08121 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col3a1P08121 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col3a1P08121 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col3a1P08121 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col3a1P08121 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col3a1P08121 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col3a1P08121 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col3a1P08121 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col3a1P08121 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col3a1P08121 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col3a1P08121 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col3a1P08121 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col3a1P08121 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Col3a1P08121 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Col3a1P08121 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col3a1P08121 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col3a1P08121 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col3a1P08121 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col3a1P08121 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col3a1P08121 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col3a1P08121 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Col3a1P08121 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col3a1P08121 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col3a1P08121 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col3a1P08121 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col3a1P08121 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col3a1P08121 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col3a1P08121 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Col3a1P08121 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Col3a1P08121 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Col3a1P08121 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Col3a1P08121 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Col3a1P08121 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Col3a1P08121 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Col3a1P08121 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Col3a1P08121 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col3a1P08121 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col3a1P08121 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col3a1P08121 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col3a1P08121 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col3a1P08121 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col3a1P08121 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col3a1P08121 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col3a1P08121 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col3a1P08121 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col3a1P08121 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col3a1P08121 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col3a1P08121 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col3a1P08121 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col3a1P08121 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col3a1P08121 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms