Protein–RNA interactions for Protein: P06800

Ptprc, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, mousemouse

Predictions only

Length 1,291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprcP06800 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
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PtprcP06800 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
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PtprcP06800 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
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PtprcP06800 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprcP06800 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
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PtprcP06800 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
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PtprcP06800 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
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PtprcP06800 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
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PtprcP06800 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
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PtprcP06800 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprcP06800 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprcP06800 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprcP06800 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
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PtprcP06800 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
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PtprcP06800 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
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PtprcP06800 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
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PtprcP06800 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
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PtprcP06800 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
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PtprcP06800 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprcP06800 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprcP06800 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprcP06800 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PtprcP06800 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PtprcP06800 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PtprcP06800 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PtprcP06800 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprcP06800 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprcP06800 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprcP06800 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprcP06800 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprcP06800 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprcP06800 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprcP06800 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprcP06800 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprcP06800 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprcP06800 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprcP06800 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms