Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxa4P06798 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxa4P06798 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxa4P06798 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxa4P06798 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxa4P06798 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxa4P06798 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxa4P06798 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxa4P06798 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxa4P06798 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxa4P06798 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxa4P06798 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxa4P06798 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxa4P06798 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxa4P06798 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxa4P06798 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa4P06798 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa4P06798 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa4P06798 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa4P06798 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa4P06798 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa4P06798 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa4P06798 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa4P06798 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxa4P06798 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxa4P06798 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxa4P06798 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxa4P06798 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxa4P06798 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxa4P06798 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxa4P06798 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxa4P06798 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxa4P06798 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxa4P06798 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxa4P06798 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa4P06798 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa4P06798 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa4P06798 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa4P06798 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa4P06798 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa4P06798 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa4P06798 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa4P06798 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa4P06798 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa4P06798 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa4P06798 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa4P06798 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa4P06798 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa4P06798 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa4P06798 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa4P06798 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa4P06798 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa4P06798 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa4P06798 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa4P06798 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa4P06798 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa4P06798 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa4P06798 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa4P06798 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa4P06798 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa4P06798 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxa4P06798 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxa4P06798 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxa4P06798 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxa4P06798 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxa4P06798 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxa4P06798 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxa4P06798 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa4P06798 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa4P06798 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa4P06798 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa4P06798 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa4P06798 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa4P06798 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa4P06798 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa4P06798 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa4P06798 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa4P06798 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa4P06798 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa4P06798 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa4P06798 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa4P06798 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa4P06798 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa4P06798 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa4P06798 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa4P06798 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa4P06798 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa4P06798 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa4P06798 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa4P06798 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa4P06798 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa4P06798 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa4P06798 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa4P06798 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa4P06798 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa4P06798 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa4P06798 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa4P06798 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa4P06798 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa4P06798 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms