Protein–RNA interactions for Protein: P05784

Krt18, Keratin, type I cytoskeletal 18, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt18P05784 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt18P05784 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt18P05784 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt18P05784 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt18P05784 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt18P05784 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt18P05784 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt18P05784 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt18P05784 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt18P05784 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt18P05784 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt18P05784 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt18P05784 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt18P05784 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt18P05784 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt18P05784 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt18P05784 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt18P05784 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt18P05784 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt18P05784 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt18P05784 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt18P05784 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt18P05784 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt18P05784 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt18P05784 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt18P05784 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt18P05784 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt18P05784 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt18P05784 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt18P05784 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt18P05784 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt18P05784 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt18P05784 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt18P05784 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt18P05784 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt18P05784 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Krt18P05784 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt18P05784 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt18P05784 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt18P05784 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt18P05784 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt18P05784 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt18P05784 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt18P05784 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt18P05784 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt18P05784 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt18P05784 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt18P05784 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt18P05784 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt18P05784 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt18P05784 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt18P05784 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt18P05784 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt18P05784 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt18P05784 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt18P05784 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt18P05784 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt18P05784 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt18P05784 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt18P05784 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt18P05784 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt18P05784 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt18P05784 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt18P05784 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt18P05784 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt18P05784 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt18P05784 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt18P05784 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt18P05784 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt18P05784 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt18P05784 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt18P05784 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt18P05784 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt18P05784 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt18P05784 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt18P05784 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt18P05784 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt18P05784 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt18P05784 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt18P05784 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt18P05784 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt18P05784 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt18P05784 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt18P05784 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt18P05784 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Krt18P05784 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Krt18P05784 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Krt18P05784 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt18P05784 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt18P05784 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt18P05784 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt18P05784 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt18P05784 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt18P05784 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt18P05784 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt18P05784 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt18P05784 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt18P05784 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt18P05784 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt18P05784 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms