Protein–RNA interactions for Protein: P05201

Got1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Got1P05201 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Got1P05201 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Got1P05201 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Got1P05201 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Got1P05201 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Got1P05201 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Got1P05201 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Got1P05201 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Got1P05201 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Got1P05201 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Got1P05201 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Got1P05201 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Got1P05201 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Got1P05201 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Got1P05201 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Got1P05201 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Got1P05201 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Got1P05201 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Got1P05201 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Got1P05201 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Got1P05201 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Got1P05201 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Got1P05201 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Got1P05201 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Got1P05201 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Got1P05201 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Got1P05201 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Got1P05201 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Got1P05201 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Got1P05201 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Got1P05201 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Got1P05201 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Got1P05201 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Got1P05201 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Got1P05201 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Got1P05201 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Got1P05201 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Got1P05201 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Got1P05201 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Got1P05201 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Got1P05201 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Got1P05201 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Got1P05201 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Got1P05201 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Got1P05201 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Got1P05201 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Got1P05201 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Got1P05201 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Got1P05201 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Got1P05201 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Got1P05201 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Got1P05201 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Got1P05201 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Got1P05201 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Got1P05201 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Got1P05201 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Got1P05201 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Got1P05201 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Got1P05201 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Got1P05201 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Got1P05201 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Got1P05201 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Got1P05201 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Got1P05201 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Got1P05201 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Got1P05201 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Got1P05201 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Got1P05201 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Got1P05201 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Got1P05201 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Got1P05201 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Got1P05201 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Got1P05201 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Got1P05201 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Got1P05201 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Got1P05201 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Got1P05201 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Got1P05201 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Got1P05201 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Got1P05201 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Got1P05201 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Got1P05201 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Got1P05201 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Got1P05201 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Got1P05201 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Got1P05201 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Got1P05201 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Got1P05201 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Got1P05201 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Got1P05201 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Got1P05201 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Got1P05201 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Got1P05201 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Got1P05201 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Got1P05201 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Got1P05201 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Got1P05201 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Got1P05201 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Got1P05201 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Got1P05201 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms