Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
H2-Eb1P04230 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
H2-Eb1P04230 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
H2-Eb1P04230 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
H2-Eb1P04230 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
H2-Eb1P04230 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-Eb1P04230 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-Eb1P04230 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-Eb1P04230 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-Eb1P04230 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-Eb1P04230 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-Eb1P04230 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-Eb1P04230 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-Eb1P04230 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-Eb1P04230 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-Eb1P04230 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-Eb1P04230 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-Eb1P04230 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-Eb1P04230 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-Eb1P04230 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-Eb1P04230 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-Eb1P04230 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-Eb1P04230 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-Eb1P04230 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-Eb1P04230 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-Eb1P04230 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-Eb1P04230 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-Eb1P04230 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-Eb1P04230 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-Eb1P04230 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-Eb1P04230 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-Eb1P04230 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2-Eb1P04230 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2-Eb1P04230 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2-Eb1P04230 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2-Eb1P04230 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2-Eb1P04230 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2-Eb1P04230 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
H2-Eb1P04230 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms