Protein–RNA interactions for Protein: P02340

Tp53, Cellular tumor antigen p53, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53P02340 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tp53P02340 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tp53P02340 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tp53P02340 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tp53P02340 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tp53P02340 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tp53P02340 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tp53P02340 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tp53P02340 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tp53P02340 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tp53P02340 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tp53P02340 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tp53P02340 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tp53P02340 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tp53P02340 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tp53P02340 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tp53P02340 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tp53P02340 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tp53P02340 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tp53P02340 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tp53P02340 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tp53P02340 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tp53P02340 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tp53P02340 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tp53P02340 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tp53P02340 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tp53P02340 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tp53P02340 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tp53P02340 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tp53P02340 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tp53P02340 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tp53P02340 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tp53P02340 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tp53P02340 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tp53P02340 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tp53P02340 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tp53P02340 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tp53P02340 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tp53P02340 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tp53P02340 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tp53P02340 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tp53P02340 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tp53P02340 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tp53P02340 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tp53P02340 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tp53P02340 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tp53P02340 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tp53P02340 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tp53P02340 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tp53P02340 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tp53P02340 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tp53P02340 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tp53P02340 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tp53P02340 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tp53P02340 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tp53P02340 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tp53P02340 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tp53P02340 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tp53P02340 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tp53P02340 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tp53P02340 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tp53P02340 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tp53P02340 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tp53P02340 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tp53P02340 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tp53P02340 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tp53P02340 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tp53P02340 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tp53P02340 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tp53P02340 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tp53P02340 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tp53P02340 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tp53P02340 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tp53P02340 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tp53P02340 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tp53P02340 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tp53P02340 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tp53P02340 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tp53P02340 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tp53P02340 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tp53P02340 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tp53P02340 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tp53P02340 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tp53P02340 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tp53P02340 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tp53P02340 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tp53P02340 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tp53P02340 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tp53P02340 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tp53P02340 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tp53P02340 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tp53P02340 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tp53P02340 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tp53P02340 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tp53P02340 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tp53P02340 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tp53P02340 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tp53P02340 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tp53P02340 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tp53P02340 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms