Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-Ab1P01921 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-Ab1P01921 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-Ab1P01921 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-Ab1P01921 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-Ab1P01921 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-Ab1P01921 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-Ab1P01921 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-Ab1P01921 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-Ab1P01921 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-Ab1P01921 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-Ab1P01921 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-Ab1P01921 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-Ab1P01921 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-Ab1P01921 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-Ab1P01921 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-Ab1P01921 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-Ab1P01921 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-Ab1P01921 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-Ab1P01921 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-Ab1P01921 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-Ab1P01921 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-Ab1P01921 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-Ab1P01921 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-Ab1P01921 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-Ab1P01921 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-Ab1P01921 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-Ab1P01921 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-Ab1P01921 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-Ab1P01921 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-Ab1P01921 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-Ab1P01921 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-Ab1P01921 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-Ab1P01921 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-Ab1P01921 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-Ab1P01921 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-Ab1P01921 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-Ab1P01921 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-Ab1P01921 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-Ab1P01921 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-Ab1P01921 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-Ab1P01921 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-Ab1P01921 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-Ab1P01921 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-Ab1P01921 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-Ab1P01921 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-Ab1P01921 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-Ab1P01921 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-Ab1P01921 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-Ab1P01921 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-Ab1P01921 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-Ab1P01921 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-Ab1P01921 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
H2-Ab1P01921 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
H2-Ab1P01921 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
H2-Ab1P01921 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-Ab1P01921 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-Ab1P01921 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-Ab1P01921 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-Ab1P01921 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-Ab1P01921 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-Ab1P01921 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-Ab1P01921 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-Ab1P01921 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-Ab1P01921 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-Ab1P01921 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-Ab1P01921 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-Ab1P01921 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-Ab1P01921 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-Ab1P01921 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-Ab1P01921 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-Ab1P01921 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-Ab1P01921 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-Ab1P01921 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-Ab1P01921 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-Ab1P01921 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-Ab1P01921 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-Ab1P01921 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-Ab1P01921 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-Ab1P01921 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-Ab1P01921 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-Ab1P01921 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-Ab1P01921 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-Ab1P01921 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-Ab1P01921 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-Ab1P01921 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-Ab1P01921 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-Ab1P01921 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-Ab1P01921 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-Ab1P01921 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-Ab1P01921 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-Ab1P01921 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-Ab1P01921 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-Ab1P01921 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-Ab1P01921 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-Ab1P01921 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-Ab1P01921 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-Ab1P01921 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-Ab1P01921 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-Ab1P01921 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms