Protein–RNA interactions for Protein: P01786

Ig heavy chain V region MOPC 47A, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01786 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01786 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01786 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01786 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01786 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01786 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01786 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01786 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01786 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01786 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01786 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01786 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01786 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01786 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01786 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P01786 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01786 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01786 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01786 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01786 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01786 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01786 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01786 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01786 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01786 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01786 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01786 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01786 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01786 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01786 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01786 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01786 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01786 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01786 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01786 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01786 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01786 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01786 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01786 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01786 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01786 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01786 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01786 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01786 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01786 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01786 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01786 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01786 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01786 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01786 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01786 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01786 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01786 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01786 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01786 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01786 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01786 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01786 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01786 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01786 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01786 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01786 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01786 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01786 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01786 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
P01786 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01786 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01786 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01786 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01786 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
P01786 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01786 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01786 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01786 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01786 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01786 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01786 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01786 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01786 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01786 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01786 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01786 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01786 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01786 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01786 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01786 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01786 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01786 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01786 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01786 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01786 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01786 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01786 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01786 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01786 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01786 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01786 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
P01786 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01786 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.02■□□□□ -0
P01786 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms