Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01649 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01649 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01649 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01649 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01649 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01649 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01649 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01649 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01649 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01649 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01649 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01649 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01649 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01649 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01649 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01649 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01649 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01649 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01649 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01649 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01649 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01649 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01649 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01649 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01649 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01649 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01649 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01649 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01649 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01649 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
P01649 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01649 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01649 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01649 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
P01649 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
P01649 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
P01649 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01649 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
P01649 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01649 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01649 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01649 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01649 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
P01649 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01649 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01649 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01649 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
P01649 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
P01649 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
P01649 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
P01649 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
P01649 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01649 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01649 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01649 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01649 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01649 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01649 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01649 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01649 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01649 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01649 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01649 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01649 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01649 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01649 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01649 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01649 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01649 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01649 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01649 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
P01649 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01649 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
P01649 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01649 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01649 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01649 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01649 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01649 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01649 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01649 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01649 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01649 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01649 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01649 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01649 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01649 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01649 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01649 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01649 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01649 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01649 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01649 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01649 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01649 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01649 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01649 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01649 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01649 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms