Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ifnb1P01575 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ifnb1P01575 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ifnb1P01575 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ifnb1P01575 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ifnb1P01575 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ifnb1P01575 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ifnb1P01575 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ifnb1P01575 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ifnb1P01575 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ifnb1P01575 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ifnb1P01575 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ifnb1P01575 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ifnb1P01575 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ifnb1P01575 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ifnb1P01575 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ifnb1P01575 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ifnb1P01575 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ifnb1P01575 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ifnb1P01575 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ifnb1P01575 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ifnb1P01575 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ifnb1P01575 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ifnb1P01575 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ifnb1P01575 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ifnb1P01575 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ifnb1P01575 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ifnb1P01575 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ifnb1P01575 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ifnb1P01575 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ifnb1P01575 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ifnb1P01575 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ifnb1P01575 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ifnb1P01575 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ifnb1P01575 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ifnb1P01575 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ifnb1P01575 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ifnb1P01575 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ifnb1P01575 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ifnb1P01575 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ifnb1P01575 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ifnb1P01575 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ifnb1P01575 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ifnb1P01575 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ifnb1P01575 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ifnb1P01575 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ifnb1P01575 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ifnb1P01575 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ifnb1P01575 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ifnb1P01575 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ifnb1P01575 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifnb1P01575 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifnb1P01575 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifnb1P01575 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifnb1P01575 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifnb1P01575 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifnb1P01575 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifnb1P01575 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifnb1P01575 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifnb1P01575 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifnb1P01575 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifnb1P01575 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifnb1P01575 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifnb1P01575 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifnb1P01575 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifnb1P01575 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ifnb1P01575 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ifnb1P01575 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ifnb1P01575 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ifnb1P01575 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ifnb1P01575 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ifnb1P01575 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ifnb1P01575 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ifnb1P01575 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ifnb1P01575 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ifnb1P01575 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifnb1P01575 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifnb1P01575 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifnb1P01575 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifnb1P01575 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifnb1P01575 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifnb1P01575 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifnb1P01575 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifnb1P01575 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifnb1P01575 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifnb1P01575 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifnb1P01575 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifnb1P01575 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifnb1P01575 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifnb1P01575 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifnb1P01575 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifnb1P01575 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifnb1P01575 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifnb1P01575 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifnb1P01575 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifnb1P01575 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifnb1P01575 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifnb1P01575 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifnb1P01575 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifnb1P01575 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms