Protein–RNA interactions for Protein: P00860

Odc1, Ornithine decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odc1P00860 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Odc1P00860 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Odc1P00860 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Odc1P00860 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Odc1P00860 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Odc1P00860 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Odc1P00860 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Odc1P00860 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Odc1P00860 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Odc1P00860 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Odc1P00860 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Odc1P00860 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Odc1P00860 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Odc1P00860 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Odc1P00860 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Odc1P00860 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Odc1P00860 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Odc1P00860 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Odc1P00860 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Odc1P00860 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Odc1P00860 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Odc1P00860 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Odc1P00860 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Odc1P00860 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Odc1P00860 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Odc1P00860 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Odc1P00860 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Odc1P00860 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Odc1P00860 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Odc1P00860 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Odc1P00860 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Odc1P00860 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Odc1P00860 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Odc1P00860 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Odc1P00860 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Odc1P00860 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Odc1P00860 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Odc1P00860 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Odc1P00860 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Odc1P00860 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Odc1P00860 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Odc1P00860 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Odc1P00860 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Odc1P00860 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Odc1P00860 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Odc1P00860 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Odc1P00860 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Odc1P00860 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Odc1P00860 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Odc1P00860 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Odc1P00860 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Odc1P00860 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Odc1P00860 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Odc1P00860 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Odc1P00860 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Odc1P00860 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Odc1P00860 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Odc1P00860 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Odc1P00860 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Odc1P00860 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Odc1P00860 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Odc1P00860 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Odc1P00860 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Odc1P00860 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Odc1P00860 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Odc1P00860 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Odc1P00860 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Odc1P00860 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Odc1P00860 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Odc1P00860 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Odc1P00860 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Odc1P00860 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Odc1P00860 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Odc1P00860 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Odc1P00860 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Odc1P00860 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Odc1P00860 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Odc1P00860 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Odc1P00860 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Odc1P00860 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Odc1P00860 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Odc1P00860 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Odc1P00860 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Odc1P00860 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Odc1P00860 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Odc1P00860 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Odc1P00860 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Odc1P00860 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Odc1P00860 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Odc1P00860 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Odc1P00860 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Odc1P00860 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Odc1P00860 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Odc1P00860 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Odc1P00860 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Odc1P00860 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
Odc1P00860 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Odc1P00860 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Odc1P00860 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Odc1P00860 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms