Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Casp8O89110 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Casp8O89110 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Casp8O89110 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Casp8O89110 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Casp8O89110 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Casp8O89110 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Casp8O89110 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Casp8O89110 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Casp8O89110 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Casp8O89110 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Casp8O89110 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Casp8O89110 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Casp8O89110 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Casp8O89110 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Casp8O89110 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Casp8O89110 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Casp8O89110 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Casp8O89110 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Casp8O89110 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Casp8O89110 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Casp8O89110 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Casp8O89110 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Casp8O89110 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Casp8O89110 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Casp8O89110 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Casp8O89110 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Casp8O89110 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Casp8O89110 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Casp8O89110 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Casp8O89110 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Casp8O89110 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Casp8O89110 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Casp8O89110 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Casp8O89110 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Casp8O89110 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Casp8O89110 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Casp8O89110 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Casp8O89110 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Casp8O89110 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Casp8O89110 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Casp8O89110 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Casp8O89110 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Casp8O89110 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Casp8O89110 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Casp8O89110 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Casp8O89110 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Casp8O89110 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Casp8O89110 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Casp8O89110 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Casp8O89110 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Casp8O89110 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Casp8O89110 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Casp8O89110 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Casp8O89110 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Casp8O89110 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Casp8O89110 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Casp8O89110 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Casp8O89110 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Casp8O89110 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Casp8O89110 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Casp8O89110 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Casp8O89110 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Casp8O89110 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Casp8O89110 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Casp8O89110 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Casp8O89110 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Casp8O89110 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Casp8O89110 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Casp8O89110 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Casp8O89110 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casp8O89110 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casp8O89110 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casp8O89110 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casp8O89110 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casp8O89110 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casp8O89110 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casp8O89110 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casp8O89110 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casp8O89110 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casp8O89110 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casp8O89110 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casp8O89110 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casp8O89110 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casp8O89110 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casp8O89110 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casp8O89110 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casp8O89110 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casp8O89110 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casp8O89110 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casp8O89110 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casp8O89110 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casp8O89110 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casp8O89110 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casp8O89110 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casp8O89110 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casp8O89110 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casp8O89110 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casp8O89110 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casp8O89110 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms