Protein–RNA interactions for Protein: O88990

Actn3, Alpha-actinin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn3O88990 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Actn3O88990 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Actn3O88990 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Actn3O88990 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Actn3O88990 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Actn3O88990 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Actn3O88990 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Actn3O88990 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Actn3O88990 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Actn3O88990 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Actn3O88990 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Actn3O88990 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Actn3O88990 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Actn3O88990 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Actn3O88990 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Actn3O88990 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Actn3O88990 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Actn3O88990 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Actn3O88990 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Actn3O88990 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Actn3O88990 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Actn3O88990 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Actn3O88990 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Actn3O88990 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Actn3O88990 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Actn3O88990 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Actn3O88990 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Actn3O88990 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Actn3O88990 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Actn3O88990 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Actn3O88990 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Actn3O88990 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Actn3O88990 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Actn3O88990 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Actn3O88990 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Actn3O88990 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Actn3O88990 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Actn3O88990 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Actn3O88990 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Actn3O88990 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Actn3O88990 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Actn3O88990 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Actn3O88990 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Actn3O88990 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Actn3O88990 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Actn3O88990 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Actn3O88990 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Actn3O88990 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Actn3O88990 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Actn3O88990 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Actn3O88990 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Actn3O88990 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Actn3O88990 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Actn3O88990 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Actn3O88990 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Actn3O88990 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Actn3O88990 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Actn3O88990 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Actn3O88990 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Actn3O88990 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Actn3O88990 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Actn3O88990 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Actn3O88990 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Actn3O88990 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Actn3O88990 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Actn3O88990 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Actn3O88990 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Actn3O88990 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Actn3O88990 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Actn3O88990 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Actn3O88990 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Actn3O88990 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Actn3O88990 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Actn3O88990 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Actn3O88990 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Actn3O88990 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Actn3O88990 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Actn3O88990 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Actn3O88990 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Actn3O88990 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Actn3O88990 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Actn3O88990 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Actn3O88990 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Actn3O88990 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Actn3O88990 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Actn3O88990 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Actn3O88990 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Actn3O88990 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Actn3O88990 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Actn3O88990 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Actn3O88990 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Actn3O88990 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Actn3O88990 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Actn3O88990 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Actn3O88990 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Actn3O88990 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Actn3O88990 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Actn3O88990 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Actn3O88990 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Actn3O88990 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms