Protein–RNA interactions for Protein: O88609

Lmx1b, LIM homeobox transcription factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1bO88609 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmx1bO88609 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmx1bO88609 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmx1bO88609 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmx1bO88609 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmx1bO88609 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmx1bO88609 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmx1bO88609 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmx1bO88609 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmx1bO88609 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmx1bO88609 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmx1bO88609 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmx1bO88609 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmx1bO88609 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmx1bO88609 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmx1bO88609 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmx1bO88609 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmx1bO88609 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmx1bO88609 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmx1bO88609 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmx1bO88609 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmx1bO88609 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmx1bO88609 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmx1bO88609 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmx1bO88609 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmx1bO88609 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmx1bO88609 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmx1bO88609 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmx1bO88609 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmx1bO88609 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmx1bO88609 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmx1bO88609 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmx1bO88609 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmx1bO88609 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmx1bO88609 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmx1bO88609 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmx1bO88609 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmx1bO88609 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmx1bO88609 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmx1bO88609 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmx1bO88609 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmx1bO88609 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmx1bO88609 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmx1bO88609 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmx1bO88609 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmx1bO88609 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmx1bO88609 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmx1bO88609 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmx1bO88609 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmx1bO88609 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmx1bO88609 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmx1bO88609 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmx1bO88609 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmx1bO88609 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmx1bO88609 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmx1bO88609 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmx1bO88609 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmx1bO88609 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmx1bO88609 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmx1bO88609 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmx1bO88609 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmx1bO88609 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmx1bO88609 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmx1bO88609 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmx1bO88609 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmx1bO88609 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmx1bO88609 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmx1bO88609 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmx1bO88609 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmx1bO88609 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmx1bO88609 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmx1bO88609 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmx1bO88609 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmx1bO88609 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmx1bO88609 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmx1bO88609 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmx1bO88609 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmx1bO88609 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmx1bO88609 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmx1bO88609 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmx1bO88609 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmx1bO88609 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmx1bO88609 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmx1bO88609 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lmx1bO88609 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lmx1bO88609 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmx1bO88609 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmx1bO88609 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmx1bO88609 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmx1bO88609 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmx1bO88609 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmx1bO88609 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmx1bO88609 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmx1bO88609 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmx1bO88609 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmx1bO88609 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmx1bO88609 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmx1bO88609 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmx1bO88609 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmx1bO88609 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms