Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nme6O88425 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nme6O88425 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nme6O88425 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nme6O88425 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nme6O88425 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nme6O88425 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nme6O88425 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nme6O88425 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nme6O88425 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nme6O88425 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nme6O88425 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nme6O88425 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nme6O88425 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nme6O88425 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nme6O88425 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nme6O88425 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nme6O88425 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nme6O88425 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nme6O88425 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nme6O88425 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nme6O88425 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nme6O88425 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nme6O88425 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Nme6O88425 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nme6O88425 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nme6O88425 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nme6O88425 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nme6O88425 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nme6O88425 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms