Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nid2O88322 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nid2O88322 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Nid2O88322 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nid2O88322 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nid2O88322 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nid2O88322 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nid2O88322 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nid2O88322 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nid2O88322 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nid2O88322 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nid2O88322 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nid2O88322 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nid2O88322 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Nid2O88322 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Nid2O88322 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nid2O88322 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nid2O88322 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nid2O88322 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nid2O88322 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nid2O88322 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nid2O88322 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nid2O88322 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nid2O88322 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nid2O88322 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nid2O88322 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nid2O88322 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nid2O88322 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nid2O88322 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nid2O88322 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nid2O88322 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nid2O88322 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nid2O88322 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nid2O88322 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nid2O88322 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nid2O88322 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nid2O88322 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nid2O88322 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nid2O88322 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nid2O88322 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nid2O88322 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nid2O88322 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nid2O88322 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nid2O88322 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nid2O88322 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nid2O88322 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nid2O88322 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nid2O88322 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nid2O88322 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nid2O88322 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nid2O88322 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nid2O88322 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nid2O88322 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nid2O88322 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nid2O88322 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nid2O88322 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nid2O88322 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nid2O88322 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nid2O88322 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nid2O88322 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nid2O88322 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nid2O88322 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nid2O88322 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nid2O88322 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nid2O88322 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nid2O88322 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nid2O88322 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nid2O88322 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Nid2O88322 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nid2O88322 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nid2O88322 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nid2O88322 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nid2O88322 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nid2O88322 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nid2O88322 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nid2O88322 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nid2O88322 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nid2O88322 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nid2O88322 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nid2O88322 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nid2O88322 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nid2O88322 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nid2O88322 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nid2O88322 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nid2O88322 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Nid2O88322 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nid2O88322 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nid2O88322 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nid2O88322 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nid2O88322 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nid2O88322 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nid2O88322 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Nid2O88322 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nid2O88322 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nid2O88322 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nid2O88322 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nid2O88322 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Nid2O88322 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nid2O88322 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nid2O88322 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms