Protein–RNA interactions for Protein: O88307

Sorl1, Sortilin-related receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorl1O88307 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sorl1O88307 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sorl1O88307 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sorl1O88307 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sorl1O88307 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sorl1O88307 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sorl1O88307 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sorl1O88307 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sorl1O88307 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sorl1O88307 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sorl1O88307 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sorl1O88307 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sorl1O88307 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sorl1O88307 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sorl1O88307 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sorl1O88307 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sorl1O88307 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sorl1O88307 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sorl1O88307 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sorl1O88307 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sorl1O88307 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sorl1O88307 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sorl1O88307 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sorl1O88307 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sorl1O88307 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sorl1O88307 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sorl1O88307 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sorl1O88307 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sorl1O88307 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sorl1O88307 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sorl1O88307 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sorl1O88307 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sorl1O88307 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sorl1O88307 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sorl1O88307 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sorl1O88307 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sorl1O88307 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sorl1O88307 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sorl1O88307 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sorl1O88307 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sorl1O88307 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sorl1O88307 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sorl1O88307 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sorl1O88307 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sorl1O88307 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sorl1O88307 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sorl1O88307 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sorl1O88307 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sorl1O88307 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sorl1O88307 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sorl1O88307 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sorl1O88307 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms