Protein–RNA interactions for Protein: O88253

Gm10226, Mszf39 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10226O88253 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm10226O88253 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm10226O88253 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm10226O88253 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm10226O88253 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm10226O88253 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm10226O88253 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm10226O88253 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms