Protein–RNA interactions for Protein: O88200

Clec11a, C-type lectin domain family 11 member A, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec11aO88200 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clec11aO88200 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clec11aO88200 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clec11aO88200 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clec11aO88200 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clec11aO88200 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clec11aO88200 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clec11aO88200 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clec11aO88200 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clec11aO88200 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clec11aO88200 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clec11aO88200 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clec11aO88200 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clec11aO88200 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clec11aO88200 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clec11aO88200 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clec11aO88200 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clec11aO88200 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clec11aO88200 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clec11aO88200 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Clec11aO88200 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Clec11aO88200 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clec11aO88200 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clec11aO88200 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clec11aO88200 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Clec11aO88200 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clec11aO88200 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clec11aO88200 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clec11aO88200 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clec11aO88200 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clec11aO88200 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clec11aO88200 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clec11aO88200 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clec11aO88200 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clec11aO88200 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clec11aO88200 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clec11aO88200 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Clec11aO88200 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clec11aO88200 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clec11aO88200 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clec11aO88200 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Clec11aO88200 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Clec11aO88200 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Clec11aO88200 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Clec11aO88200 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Clec11aO88200 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clec11aO88200 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clec11aO88200 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clec11aO88200 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clec11aO88200 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Clec11aO88200 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clec11aO88200 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Clec11aO88200 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clec11aO88200 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clec11aO88200 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clec11aO88200 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clec11aO88200 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clec11aO88200 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clec11aO88200 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Clec11aO88200 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clec11aO88200 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clec11aO88200 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clec11aO88200 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clec11aO88200 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clec11aO88200 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clec11aO88200 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clec11aO88200 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clec11aO88200 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clec11aO88200 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clec11aO88200 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clec11aO88200 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clec11aO88200 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clec11aO88200 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clec11aO88200 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clec11aO88200 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clec11aO88200 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Clec11aO88200 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Clec11aO88200 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clec11aO88200 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clec11aO88200 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clec11aO88200 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clec11aO88200 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clec11aO88200 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clec11aO88200 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clec11aO88200 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clec11aO88200 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clec11aO88200 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clec11aO88200 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clec11aO88200 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clec11aO88200 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clec11aO88200 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clec11aO88200 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clec11aO88200 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Clec11aO88200 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clec11aO88200 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clec11aO88200 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clec11aO88200 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Clec11aO88200 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clec11aO88200 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clec11aO88200 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms