Protein–RNA interactions for Protein: O70340

Nptx2, Neuronal pentraxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx2O70340 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nptx2O70340 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nptx2O70340 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nptx2O70340 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nptx2O70340 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nptx2O70340 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nptx2O70340 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nptx2O70340 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nptx2O70340 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nptx2O70340 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Nptx2O70340 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nptx2O70340 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nptx2O70340 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nptx2O70340 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nptx2O70340 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nptx2O70340 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nptx2O70340 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nptx2O70340 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nptx2O70340 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nptx2O70340 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nptx2O70340 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nptx2O70340 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nptx2O70340 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nptx2O70340 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nptx2O70340 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Nptx2O70340 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nptx2O70340 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nptx2O70340 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nptx2O70340 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nptx2O70340 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nptx2O70340 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nptx2O70340 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nptx2O70340 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nptx2O70340 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nptx2O70340 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nptx2O70340 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nptx2O70340 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nptx2O70340 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nptx2O70340 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nptx2O70340 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nptx2O70340 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nptx2O70340 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nptx2O70340 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nptx2O70340 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nptx2O70340 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nptx2O70340 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nptx2O70340 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nptx2O70340 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nptx2O70340 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nptx2O70340 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nptx2O70340 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nptx2O70340 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nptx2O70340 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nptx2O70340 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nptx2O70340 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nptx2O70340 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nptx2O70340 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nptx2O70340 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nptx2O70340 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nptx2O70340 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nptx2O70340 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nptx2O70340 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nptx2O70340 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nptx2O70340 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nptx2O70340 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nptx2O70340 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nptx2O70340 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nptx2O70340 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nptx2O70340 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nptx2O70340 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nptx2O70340 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nptx2O70340 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nptx2O70340 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nptx2O70340 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nptx2O70340 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nptx2O70340 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nptx2O70340 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nptx2O70340 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nptx2O70340 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nptx2O70340 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nptx2O70340 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nptx2O70340 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nptx2O70340 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nptx2O70340 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nptx2O70340 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nptx2O70340 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nptx2O70340 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nptx2O70340 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nptx2O70340 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nptx2O70340 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nptx2O70340 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nptx2O70340 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nptx2O70340 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nptx2O70340 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nptx2O70340 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nptx2O70340 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nptx2O70340 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nptx2O70340 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nptx2O70340 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nptx2O70340 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms