Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itgb5O70309 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itgb5O70309 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itgb5O70309 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itgb5O70309 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itgb5O70309 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itgb5O70309 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itgb5O70309 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itgb5O70309 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Itgb5O70309 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itgb5O70309 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itgb5O70309 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itgb5O70309 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itgb5O70309 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itgb5O70309 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itgb5O70309 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Itgb5O70309 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itgb5O70309 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itgb5O70309 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itgb5O70309 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itgb5O70309 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itgb5O70309 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itgb5O70309 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itgb5O70309 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itgb5O70309 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itgb5O70309 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itgb5O70309 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itgb5O70309 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itgb5O70309 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itgb5O70309 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itgb5O70309 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itgb5O70309 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itgb5O70309 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itgb5O70309 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itgb5O70309 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itgb5O70309 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itgb5O70309 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Itgb5O70309 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itgb5O70309 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itgb5O70309 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itgb5O70309 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itgb5O70309 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itgb5O70309 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itgb5O70309 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itgb5O70309 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itgb5O70309 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itgb5O70309 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Itgb5O70309 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itgb5O70309 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Itgb5O70309 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itgb5O70309 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itgb5O70309 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itgb5O70309 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itgb5O70309 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itgb5O70309 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itgb5O70309 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itgb5O70309 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itgb5O70309 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itgb5O70309 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itgb5O70309 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itgb5O70309 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itgb5O70309 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itgb5O70309 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itgb5O70309 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itgb5O70309 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Itgb5O70309 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itgb5O70309 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itgb5O70309 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itgb5O70309 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Itgb5O70309 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itgb5O70309 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itgb5O70309 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itgb5O70309 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itgb5O70309 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itgb5O70309 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itgb5O70309 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itgb5O70309 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itgb5O70309 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itgb5O70309 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itgb5O70309 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itgb5O70309 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itgb5O70309 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itgb5O70309 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itgb5O70309 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itgb5O70309 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Itgb5O70309 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itgb5O70309 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itgb5O70309 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itgb5O70309 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itgb5O70309 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itgb5O70309 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itgb5O70309 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itgb5O70309 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itgb5O70309 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itgb5O70309 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itgb5O70309 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itgb5O70309 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itgb5O70309 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Itgb5O70309 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itgb5O70309 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms