Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Chrna4O70174 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Chrna4O70174 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Chrna4O70174 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Chrna4O70174 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Chrna4O70174 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Chrna4O70174 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Chrna4O70174 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Chrna4O70174 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Chrna4O70174 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Chrna4O70174 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chrna4O70174 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Chrna4O70174 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Chrna4O70174 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Chrna4O70174 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chrna4O70174 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chrna4O70174 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chrna4O70174 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chrna4O70174 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chrna4O70174 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chrna4O70174 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chrna4O70174 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chrna4O70174 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chrna4O70174 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chrna4O70174 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chrna4O70174 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chrna4O70174 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chrna4O70174 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chrna4O70174 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Chrna4O70174 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chrna4O70174 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chrna4O70174 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chrna4O70174 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms