Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cbx4O55187 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cbx4O55187 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cbx4O55187 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cbx4O55187 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cbx4O55187 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cbx4O55187 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cbx4O55187 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cbx4O55187 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cbx4O55187 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cbx4O55187 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cbx4O55187 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cbx4O55187 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cbx4O55187 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cbx4O55187 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cbx4O55187 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Cbx4O55187 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cbx4O55187 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cbx4O55187 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cbx4O55187 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cbx4O55187 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cbx4O55187 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cbx4O55187 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cbx4O55187 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cbx4O55187 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cbx4O55187 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cbx4O55187 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cbx4O55187 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx4O55187 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx4O55187 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx4O55187 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx4O55187 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx4O55187 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx4O55187 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx4O55187 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx4O55187 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx4O55187 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx4O55187 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx4O55187 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cbx4O55187 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cbx4O55187 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cbx4O55187 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cbx4O55187 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cbx4O55187 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cbx4O55187 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cbx4O55187 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cbx4O55187 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cbx4O55187 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cbx4O55187 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cbx4O55187 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cbx4O55187 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cbx4O55187 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cbx4O55187 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cbx4O55187 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cbx4O55187 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cbx4O55187 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cbx4O55187 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cbx4O55187 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cbx4O55187 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cbx4O55187 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cbx4O55187 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cbx4O55187 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cbx4O55187 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cbx4O55187 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cbx4O55187 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cbx4O55187 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cbx4O55187 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cbx4O55187 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cbx4O55187 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cbx4O55187 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cbx4O55187 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cbx4O55187 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cbx4O55187 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cbx4O55187 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Cbx4O55187 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cbx4O55187 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cbx4O55187 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cbx4O55187 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cbx4O55187 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cbx4O55187 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cbx4O55187 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Cbx4O55187 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cbx4O55187 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cbx4O55187 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cbx4O55187 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cbx4O55187 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cbx4O55187 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cbx4O55187 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cbx4O55187 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cbx4O55187 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cbx4O55187 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Cbx4O55187 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms