Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl35aO55142 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl35aO55142 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl35aO55142 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl35aO55142 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl35aO55142 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl35aO55142 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl35aO55142 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rpl35aO55142 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl35aO55142 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl35aO55142 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl35aO55142 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl35aO55142 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl35aO55142 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl35aO55142 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl35aO55142 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl35aO55142 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl35aO55142 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl35aO55142 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl35aO55142 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl35aO55142 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rpl35aO55142 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl35aO55142 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl35aO55142 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms