Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PrxO55103 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PrxO55103 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PrxO55103 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PrxO55103 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PrxO55103 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PrxO55103 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PrxO55103 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PrxO55103 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PrxO55103 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PrxO55103 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PrxO55103 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PrxO55103 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PrxO55103 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PrxO55103 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PrxO55103 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PrxO55103 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PrxO55103 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PrxO55103 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PrxO55103 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PrxO55103 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PrxO55103 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PrxO55103 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PrxO55103 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PrxO55103 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PrxO55103 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PrxO55103 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PrxO55103 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PrxO55103 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PrxO55103 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PrxO55103 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PrxO55103 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PrxO55103 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PrxO55103 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PrxO55103 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PrxO55103 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PrxO55103 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PrxO55103 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PrxO55103 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PrxO55103 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PrxO55103 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PrxO55103 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PrxO55103 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PrxO55103 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PrxO55103 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PrxO55103 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PrxO55103 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PrxO55103 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PrxO55103 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PrxO55103 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PrxO55103 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PrxO55103 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PrxO55103 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PrxO55103 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PrxO55103 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PrxO55103 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PrxO55103 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PrxO55103 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PrxO55103 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PrxO55103 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PrxO55103 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PrxO55103 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PrxO55103 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PrxO55103 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PrxO55103 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PrxO55103 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PrxO55103 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PrxO55103 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PrxO55103 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PrxO55103 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PrxO55103 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PrxO55103 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PrxO55103 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PrxO55103 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PrxO55103 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PrxO55103 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PrxO55103 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PrxO55103 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PrxO55103 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PrxO55103 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PrxO55103 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PrxO55103 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PrxO55103 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PrxO55103 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PrxO55103 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PrxO55103 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PrxO55103 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PrxO55103 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PrxO55103 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PrxO55103 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PrxO55103 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PrxO55103 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PrxO55103 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PrxO55103 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PrxO55103 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PrxO55103 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PrxO55103 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PrxO55103 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PrxO55103 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PrxO55103 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms