Protein–RNA interactions for Protein: O55055

Trdmt1, tRNA (cytosine(38)-C(5))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdmt1O55055 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trdmt1O55055 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trdmt1O55055 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trdmt1O55055 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trdmt1O55055 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trdmt1O55055 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trdmt1O55055 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trdmt1O55055 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trdmt1O55055 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trdmt1O55055 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trdmt1O55055 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trdmt1O55055 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trdmt1O55055 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Trdmt1O55055 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trdmt1O55055 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trdmt1O55055 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Trdmt1O55055 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trdmt1O55055 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trdmt1O55055 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trdmt1O55055 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trdmt1O55055 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trdmt1O55055 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trdmt1O55055 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trdmt1O55055 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Trdmt1O55055 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trdmt1O55055 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trdmt1O55055 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trdmt1O55055 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trdmt1O55055 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trdmt1O55055 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trdmt1O55055 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Trdmt1O55055 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trdmt1O55055 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trdmt1O55055 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trdmt1O55055 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trdmt1O55055 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trdmt1O55055 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trdmt1O55055 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trdmt1O55055 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trdmt1O55055 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trdmt1O55055 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trdmt1O55055 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trdmt1O55055 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trdmt1O55055 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trdmt1O55055 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trdmt1O55055 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trdmt1O55055 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trdmt1O55055 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trdmt1O55055 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trdmt1O55055 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trdmt1O55055 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Trdmt1O55055 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trdmt1O55055 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trdmt1O55055 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trdmt1O55055 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trdmt1O55055 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trdmt1O55055 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trdmt1O55055 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trdmt1O55055 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Trdmt1O55055 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Trdmt1O55055 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trdmt1O55055 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trdmt1O55055 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trdmt1O55055 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trdmt1O55055 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trdmt1O55055 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trdmt1O55055 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trdmt1O55055 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trdmt1O55055 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trdmt1O55055 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trdmt1O55055 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trdmt1O55055 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trdmt1O55055 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trdmt1O55055 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trdmt1O55055 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trdmt1O55055 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trdmt1O55055 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trdmt1O55055 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trdmt1O55055 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trdmt1O55055 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trdmt1O55055 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trdmt1O55055 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trdmt1O55055 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trdmt1O55055 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trdmt1O55055 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trdmt1O55055 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trdmt1O55055 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trdmt1O55055 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trdmt1O55055 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trdmt1O55055 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trdmt1O55055 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trdmt1O55055 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trdmt1O55055 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trdmt1O55055 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trdmt1O55055 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trdmt1O55055 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trdmt1O55055 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trdmt1O55055 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trdmt1O55055 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trdmt1O55055 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms