Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc3O55013 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc3O55013 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trappc3O55013 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trappc3O55013 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trappc3O55013 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trappc3O55013 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Trappc3O55013 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trappc3O55013 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trappc3O55013 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trappc3O55013 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trappc3O55013 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trappc3O55013 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trappc3O55013 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trappc3O55013 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trappc3O55013 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trappc3O55013 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trappc3O55013 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc3O55013 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc3O55013 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc3O55013 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc3O55013 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc3O55013 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc3O55013 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc3O55013 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc3O55013 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc3O55013 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc3O55013 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc3O55013 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc3O55013 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc3O55013 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc3O55013 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc3O55013 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc3O55013 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc3O55013 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc3O55013 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc3O55013 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc3O55013 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc3O55013 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc3O55013 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc3O55013 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc3O55013 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc3O55013 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc3O55013 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc3O55013 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc3O55013 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc3O55013 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc3O55013 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc3O55013 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc3O55013 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc3O55013 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc3O55013 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trappc3O55013 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trappc3O55013 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trappc3O55013 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trappc3O55013 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Trappc3O55013 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Trappc3O55013 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trappc3O55013 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc3O55013 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc3O55013 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc3O55013 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc3O55013 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc3O55013 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc3O55013 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc3O55013 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc3O55013 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc3O55013 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc3O55013 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc3O55013 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc3O55013 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc3O55013 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc3O55013 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc3O55013 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc3O55013 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc3O55013 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc3O55013 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc3O55013 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc3O55013 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc3O55013 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc3O55013 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc3O55013 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc3O55013 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc3O55013 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc3O55013 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc3O55013 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc3O55013 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc3O55013 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc3O55013 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc3O55013 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc3O55013 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc3O55013 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc3O55013 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc3O55013 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc3O55013 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc3O55013 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc3O55013 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc3O55013 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc3O55013 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc3O55013 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms