Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SlkO54988 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SlkO54988 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SlkO54988 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SlkO54988 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SlkO54988 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SlkO54988 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SlkO54988 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SlkO54988 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SlkO54988 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SlkO54988 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SlkO54988 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SlkO54988 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SlkO54988 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SlkO54988 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SlkO54988 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SlkO54988 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SlkO54988 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SlkO54988 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SlkO54988 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SlkO54988 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SlkO54988 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SlkO54988 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SlkO54988 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SlkO54988 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SlkO54988 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SlkO54988 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SlkO54988 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SlkO54988 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SlkO54988 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SlkO54988 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SlkO54988 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SlkO54988 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SlkO54988 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SlkO54988 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SlkO54988 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SlkO54988 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SlkO54988 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SlkO54988 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SlkO54988 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SlkO54988 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SlkO54988 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SlkO54988 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SlkO54988 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SlkO54988 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SlkO54988 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SlkO54988 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SlkO54988 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SlkO54988 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SlkO54988 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SlkO54988 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SlkO54988 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SlkO54988 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SlkO54988 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SlkO54988 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SlkO54988 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SlkO54988 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SlkO54988 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SlkO54988 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SlkO54988 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SlkO54988 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SlkO54988 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SlkO54988 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SlkO54988 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SlkO54988 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SlkO54988 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SlkO54988 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SlkO54988 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SlkO54988 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SlkO54988 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SlkO54988 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SlkO54988 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SlkO54988 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SlkO54988 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SlkO54988 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SlkO54988 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SlkO54988 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SlkO54988 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SlkO54988 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SlkO54988 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SlkO54988 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SlkO54988 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SlkO54988 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SlkO54988 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SlkO54988 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SlkO54988 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SlkO54988 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SlkO54988 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SlkO54988 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SlkO54988 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SlkO54988 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SlkO54988 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SlkO54988 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SlkO54988 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SlkO54988 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SlkO54988 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SlkO54988 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SlkO54988 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SlkO54988 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SlkO54988 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms