Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itgb3O54890 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itgb3O54890 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itgb3O54890 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itgb3O54890 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itgb3O54890 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itgb3O54890 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itgb3O54890 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itgb3O54890 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itgb3O54890 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itgb3O54890 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itgb3O54890 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itgb3O54890 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgb3O54890 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgb3O54890 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgb3O54890 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgb3O54890 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgb3O54890 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgb3O54890 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgb3O54890 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itgb3O54890 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itgb3O54890 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itgb3O54890 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itgb3O54890 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itgb3O54890 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itgb3O54890 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itgb3O54890 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itgb3O54890 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itgb3O54890 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itgb3O54890 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itgb3O54890 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itgb3O54890 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itgb3O54890 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itgb3O54890 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itgb3O54890 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Itgb3O54890 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itgb3O54890 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itgb3O54890 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itgb3O54890 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Itgb3O54890 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itgb3O54890 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itgb3O54890 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgb3O54890 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgb3O54890 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgb3O54890 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgb3O54890 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgb3O54890 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgb3O54890 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgb3O54890 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgb3O54890 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgb3O54890 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgb3O54890 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgb3O54890 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgb3O54890 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgb3O54890 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgb3O54890 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgb3O54890 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgb3O54890 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgb3O54890 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgb3O54890 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgb3O54890 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgb3O54890 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgb3O54890 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgb3O54890 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgb3O54890 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgb3O54890 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgb3O54890 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgb3O54890 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgb3O54890 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgb3O54890 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgb3O54890 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgb3O54890 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgb3O54890 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Itgb3O54890 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Itgb3O54890 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itgb3O54890 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itgb3O54890 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itgb3O54890 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itgb3O54890 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itgb3O54890 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itgb3O54890 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itgb3O54890 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itgb3O54890 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itgb3O54890 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itgb3O54890 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Itgb3O54890 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itgb3O54890 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itgb3O54890 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itgb3O54890 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itgb3O54890 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Itgb3O54890 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itgb3O54890 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itgb3O54890 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itgb3O54890 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itgb3O54890 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itgb3O54890 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itgb3O54890 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itgb3O54890 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgb3O54890 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgb3O54890 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms