Protein–RNA interactions for Protein: O54689

Ccr6, C-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr6O54689 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccr6O54689 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccr6O54689 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccr6O54689 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccr6O54689 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccr6O54689 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccr6O54689 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccr6O54689 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccr6O54689 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccr6O54689 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccr6O54689 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccr6O54689 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccr6O54689 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccr6O54689 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr6O54689 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr6O54689 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr6O54689 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr6O54689 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr6O54689 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr6O54689 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr6O54689 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr6O54689 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr6O54689 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr6O54689 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr6O54689 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr6O54689 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr6O54689 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr6O54689 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr6O54689 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr6O54689 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr6O54689 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr6O54689 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr6O54689 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr6O54689 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr6O54689 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr6O54689 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr6O54689 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr6O54689 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr6O54689 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr6O54689 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr6O54689 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr6O54689 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr6O54689 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr6O54689 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr6O54689 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr6O54689 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr6O54689 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccr6O54689 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccr6O54689 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccr6O54689 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccr6O54689 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccr6O54689 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccr6O54689 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccr6O54689 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccr6O54689 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccr6O54689 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccr6O54689 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccr6O54689 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccr6O54689 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccr6O54689 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccr6O54689 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccr6O54689 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccr6O54689 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccr6O54689 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccr6O54689 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccr6O54689 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccr6O54689 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccr6O54689 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccr6O54689 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccr6O54689 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccr6O54689 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccr6O54689 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccr6O54689 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccr6O54689 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccr6O54689 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccr6O54689 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccr6O54689 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccr6O54689 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccr6O54689 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccr6O54689 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccr6O54689 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccr6O54689 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccr6O54689 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccr6O54689 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccr6O54689 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccr6O54689 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccr6O54689 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccr6O54689 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccr6O54689 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccr6O54689 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccr6O54689 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccr6O54689 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccr6O54689 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccr6O54689 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccr6O54689 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccr6O54689 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccr6O54689 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccr6O54689 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccr6O54689 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccr6O54689 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms