Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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FxnO35943 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FxnO35943 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FxnO35943 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FxnO35943 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FxnO35943 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FxnO35943 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FxnO35943 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FxnO35943 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FxnO35943 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FxnO35943 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FxnO35943 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FxnO35943 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FxnO35943 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FxnO35943 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FxnO35943 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FxnO35943 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FxnO35943 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FxnO35943 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FxnO35943 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FxnO35943 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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FxnO35943 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FxnO35943 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FxnO35943 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FxnO35943 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FxnO35943 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FxnO35943 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FxnO35943 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FxnO35943 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
FxnO35943 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FxnO35943 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FxnO35943 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FxnO35943 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FxnO35943 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FxnO35943 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FxnO35943 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FxnO35943 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FxnO35943 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FxnO35943 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FxnO35943 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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FxnO35943 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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FxnO35943 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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FxnO35943 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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FxnO35943 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FxnO35943 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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FxnO35943 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
FxnO35943 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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FxnO35943 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FxnO35943 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FxnO35943 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FxnO35943 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FxnO35943 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
FxnO35943 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FxnO35943 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FxnO35943 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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FxnO35943 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FxnO35943 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FxnO35943 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FxnO35943 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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FxnO35943 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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