Protein–RNA interactions for Protein: O35926

Cdk5r2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r2O35926 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdk5r2O35926 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdk5r2O35926 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdk5r2O35926 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdk5r2O35926 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdk5r2O35926 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdk5r2O35926 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdk5r2O35926 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdk5r2O35926 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdk5r2O35926 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdk5r2O35926 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdk5r2O35926 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdk5r2O35926 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdk5r2O35926 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdk5r2O35926 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdk5r2O35926 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdk5r2O35926 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdk5r2O35926 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdk5r2O35926 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdk5r2O35926 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdk5r2O35926 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdk5r2O35926 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdk5r2O35926 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdk5r2O35926 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdk5r2O35926 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdk5r2O35926 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdk5r2O35926 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdk5r2O35926 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdk5r2O35926 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdk5r2O35926 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdk5r2O35926 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdk5r2O35926 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdk5r2O35926 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdk5r2O35926 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdk5r2O35926 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdk5r2O35926 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdk5r2O35926 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdk5r2O35926 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdk5r2O35926 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdk5r2O35926 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cdk5r2O35926 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cdk5r2O35926 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cdk5r2O35926 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cdk5r2O35926 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdk5r2O35926 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdk5r2O35926 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdk5r2O35926 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdk5r2O35926 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdk5r2O35926 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdk5r2O35926 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Cdk5r2O35926 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdk5r2O35926 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdk5r2O35926 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdk5r2O35926 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Cdk5r2O35926 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cdk5r2O35926 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdk5r2O35926 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Cdk5r2O35926 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdk5r2O35926 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdk5r2O35926 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdk5r2O35926 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cdk5r2O35926 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdk5r2O35926 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdk5r2O35926 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdk5r2O35926 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdk5r2O35926 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdk5r2O35926 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdk5r2O35926 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdk5r2O35926 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdk5r2O35926 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdk5r2O35926 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdk5r2O35926 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdk5r2O35926 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdk5r2O35926 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdk5r2O35926 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdk5r2O35926 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdk5r2O35926 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdk5r2O35926 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdk5r2O35926 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdk5r2O35926 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdk5r2O35926 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdk5r2O35926 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdk5r2O35926 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdk5r2O35926 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdk5r2O35926 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdk5r2O35926 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdk5r2O35926 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdk5r2O35926 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdk5r2O35926 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdk5r2O35926 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdk5r2O35926 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdk5r2O35926 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdk5r2O35926 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdk5r2O35926 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdk5r2O35926 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdk5r2O35926 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdk5r2O35926 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdk5r2O35926 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdk5r2O35926 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdk5r2O35926 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.5 ms