Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sp100O35892 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sp100O35892 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sp100O35892 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sp100O35892 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sp100O35892 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sp100O35892 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sp100O35892 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sp100O35892 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sp100O35892 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sp100O35892 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sp100O35892 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sp100O35892 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sp100O35892 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sp100O35892 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sp100O35892 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sp100O35892 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sp100O35892 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sp100O35892 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sp100O35892 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sp100O35892 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sp100O35892 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sp100O35892 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sp100O35892 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sp100O35892 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sp100O35892 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sp100O35892 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sp100O35892 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sp100O35892 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sp100O35892 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sp100O35892 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sp100O35892 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sp100O35892 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sp100O35892 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sp100O35892 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sp100O35892 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sp100O35892 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sp100O35892 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sp100O35892 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sp100O35892 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sp100O35892 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sp100O35892 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sp100O35892 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sp100O35892 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sp100O35892 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sp100O35892 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sp100O35892 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sp100O35892 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sp100O35892 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sp100O35892 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sp100O35892 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sp100O35892 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sp100O35892 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sp100O35892 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sp100O35892 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sp100O35892 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sp100O35892 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sp100O35892 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sp100O35892 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sp100O35892 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sp100O35892 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sp100O35892 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sp100O35892 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sp100O35892 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sp100O35892 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sp100O35892 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sp100O35892 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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Sp100O35892 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sp100O35892 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sp100O35892 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sp100O35892 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sp100O35892 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sp100O35892 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sp100O35892 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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Sp100O35892 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sp100O35892 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sp100O35892 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sp100O35892 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sp100O35892 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sp100O35892 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sp100O35892 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sp100O35892 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sp100O35892 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sp100O35892 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sp100O35892 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sp100O35892 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sp100O35892 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sp100O35892 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sp100O35892 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sp100O35892 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sp100O35892 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sp100O35892 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sp100O35892 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sp100O35892 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sp100O35892 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Sp100O35892 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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