Protein–RNA interactions for Protein: O35864

Cops5, COP9 signalosome complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops5O35864 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cops5O35864 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cops5O35864 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cops5O35864 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cops5O35864 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cops5O35864 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cops5O35864 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cops5O35864 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cops5O35864 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cops5O35864 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cops5O35864 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cops5O35864 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cops5O35864 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cops5O35864 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cops5O35864 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cops5O35864 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cops5O35864 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cops5O35864 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cops5O35864 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cops5O35864 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cops5O35864 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cops5O35864 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cops5O35864 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cops5O35864 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cops5O35864 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cops5O35864 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cops5O35864 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cops5O35864 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cops5O35864 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cops5O35864 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cops5O35864 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cops5O35864 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cops5O35864 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cops5O35864 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cops5O35864 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cops5O35864 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cops5O35864 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cops5O35864 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cops5O35864 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cops5O35864 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cops5O35864 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cops5O35864 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cops5O35864 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cops5O35864 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cops5O35864 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cops5O35864 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cops5O35864 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cops5O35864 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cops5O35864 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cops5O35864 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cops5O35864 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cops5O35864 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cops5O35864 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cops5O35864 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cops5O35864 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cops5O35864 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cops5O35864 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cops5O35864 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cops5O35864 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cops5O35864 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cops5O35864 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cops5O35864 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cops5O35864 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cops5O35864 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cops5O35864 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cops5O35864 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cops5O35864 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cops5O35864 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cops5O35864 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cops5O35864 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cops5O35864 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cops5O35864 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cops5O35864 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cops5O35864 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cops5O35864 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cops5O35864 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cops5O35864 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cops5O35864 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cops5O35864 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cops5O35864 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cops5O35864 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cops5O35864 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cops5O35864 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cops5O35864 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cops5O35864 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cops5O35864 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cops5O35864 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cops5O35864 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cops5O35864 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cops5O35864 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cops5O35864 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cops5O35864 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cops5O35864 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cops5O35864 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cops5O35864 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cops5O35864 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cops5O35864 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cops5O35864 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cops5O35864 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cops5O35864 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms