Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf9O35739 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf9O35739 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf9O35739 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf9O35739 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf9O35739 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf9O35739 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf9O35739 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf9O35739 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf9O35739 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf9O35739 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf9O35739 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf9O35739 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf9O35739 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf9O35739 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf9O35739 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf9O35739 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf9O35739 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf9O35739 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf9O35739 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf9O35739 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf9O35739 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf9O35739 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf9O35739 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf9O35739 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf9O35739 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf9O35739 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf9O35739 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf9O35739 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf9O35739 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf9O35739 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf9O35739 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf9O35739 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf9O35739 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf9O35739 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf9O35739 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf9O35739 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf9O35739 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf9O35739 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf9O35739 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf9O35739 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf9O35739 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf9O35739 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf9O35739 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf9O35739 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf9O35739 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf9O35739 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf9O35739 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf9O35739 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Klf9O35739 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Klf9O35739 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf9O35739 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf9O35739 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf9O35739 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf9O35739 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf9O35739 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf9O35739 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf9O35739 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf9O35739 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf9O35739 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf9O35739 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf9O35739 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf9O35739 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf9O35739 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf9O35739 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf9O35739 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf9O35739 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf9O35739 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf9O35739 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf9O35739 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf9O35739 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf9O35739 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf9O35739 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf9O35739 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf9O35739 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf9O35739 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf9O35739 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf9O35739 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf9O35739 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf9O35739 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf9O35739 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf9O35739 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf9O35739 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf9O35739 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf9O35739 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf9O35739 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf9O35739 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf9O35739 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf9O35739 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf9O35739 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf9O35739 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf9O35739 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf9O35739 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf9O35739 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf9O35739 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf9O35739 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf9O35739 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf9O35739 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf9O35739 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf9O35739 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms