Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ppfibp2O35711 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ppfibp2O35711 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ppfibp2O35711 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ppfibp2O35711 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ppfibp2O35711 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ppfibp2O35711 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ppfibp2O35711 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ppfibp2O35711 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ppfibp2O35711 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Ppfibp2O35711 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ppfibp2O35711 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ppfibp2O35711 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ppfibp2O35711 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppfibp2O35711 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppfibp2O35711 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppfibp2O35711 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppfibp2O35711 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppfibp2O35711 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppfibp2O35711 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppfibp2O35711 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppfibp2O35711 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppfibp2O35711 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppfibp2O35711 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppfibp2O35711 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ppfibp2O35711 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ppfibp2O35711 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ppfibp2O35711 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ppfibp2O35711 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ppfibp2O35711 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppfibp2O35711 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppfibp2O35711 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppfibp2O35711 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppfibp2O35711 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppfibp2O35711 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppfibp2O35711 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppfibp2O35711 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppfibp2O35711 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppfibp2O35711 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppfibp2O35711 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppfibp2O35711 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppfibp2O35711 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppfibp2O35711 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppfibp2O35711 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppfibp2O35711 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppfibp2O35711 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppfibp2O35711 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppfibp2O35711 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppfibp2O35711 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppfibp2O35711 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ppfibp2O35711 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ppfibp2O35711 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ppfibp2O35711 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ppfibp2O35711 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ppfibp2O35711 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ppfibp2O35711 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ppfibp2O35711 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ppfibp2O35711 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ppfibp2O35711 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ppfibp2O35711 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ppfibp2O35711 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ppfibp2O35711 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ppfibp2O35711 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ppfibp2O35711 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ppfibp2O35711 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ppfibp2O35711 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ppfibp2O35711 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ppfibp2O35711 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ppfibp2O35711 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ppfibp2O35711 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ppfibp2O35711 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ppfibp2O35711 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppfibp2O35711 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppfibp2O35711 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppfibp2O35711 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppfibp2O35711 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppfibp2O35711 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppfibp2O35711 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ppfibp2O35711 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ppfibp2O35711 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ppfibp2O35711 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ppfibp2O35711 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ppfibp2O35711 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ppfibp2O35711 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ppfibp2O35711 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ppfibp2O35711 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ppfibp2O35711 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ppfibp2O35711 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppfibp2O35711 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppfibp2O35711 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppfibp2O35711 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppfibp2O35711 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppfibp2O35711 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppfibp2O35711 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppfibp2O35711 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppfibp2O35711 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppfibp2O35711 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppfibp2O35711 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppfibp2O35711 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppfibp2O35711 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms