Protein–RNA interactions for Protein: O35704

Sptlc1, Serine palmitoyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptlc1O35704 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sptlc1O35704 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sptlc1O35704 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sptlc1O35704 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sptlc1O35704 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sptlc1O35704 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sptlc1O35704 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sptlc1O35704 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sptlc1O35704 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sptlc1O35704 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sptlc1O35704 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sptlc1O35704 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sptlc1O35704 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sptlc1O35704 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sptlc1O35704 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sptlc1O35704 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sptlc1O35704 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sptlc1O35704 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sptlc1O35704 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sptlc1O35704 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sptlc1O35704 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sptlc1O35704 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sptlc1O35704 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sptlc1O35704 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sptlc1O35704 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sptlc1O35704 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sptlc1O35704 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sptlc1O35704 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sptlc1O35704 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sptlc1O35704 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sptlc1O35704 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sptlc1O35704 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sptlc1O35704 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sptlc1O35704 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sptlc1O35704 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sptlc1O35704 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sptlc1O35704 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sptlc1O35704 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sptlc1O35704 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sptlc1O35704 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sptlc1O35704 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sptlc1O35704 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sptlc1O35704 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sptlc1O35704 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sptlc1O35704 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Sptlc1O35704 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Sptlc1O35704 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sptlc1O35704 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Sptlc1O35704 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sptlc1O35704 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Sptlc1O35704 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sptlc1O35704 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sptlc1O35704 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sptlc1O35704 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sptlc1O35704 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sptlc1O35704 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sptlc1O35704 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sptlc1O35704 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sptlc1O35704 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sptlc1O35704 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sptlc1O35704 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sptlc1O35704 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sptlc1O35704 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sptlc1O35704 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sptlc1O35704 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sptlc1O35704 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sptlc1O35704 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sptlc1O35704 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sptlc1O35704 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sptlc1O35704 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sptlc1O35704 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sptlc1O35704 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sptlc1O35704 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sptlc1O35704 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sptlc1O35704 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sptlc1O35704 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sptlc1O35704 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sptlc1O35704 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sptlc1O35704 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sptlc1O35704 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sptlc1O35704 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sptlc1O35704 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sptlc1O35704 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Sptlc1O35704 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sptlc1O35704 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sptlc1O35704 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sptlc1O35704 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sptlc1O35704 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sptlc1O35704 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sptlc1O35704 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sptlc1O35704 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sptlc1O35704 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sptlc1O35704 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sptlc1O35704 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sptlc1O35704 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sptlc1O35704 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sptlc1O35704 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sptlc1O35704 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sptlc1O35704 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sptlc1O35704 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms