Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NudcO35685 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NudcO35685 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NudcO35685 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NudcO35685 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NudcO35685 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NudcO35685 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NudcO35685 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NudcO35685 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NudcO35685 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NudcO35685 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NudcO35685 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NudcO35685 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NudcO35685 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NudcO35685 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NudcO35685 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NudcO35685 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NudcO35685 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NudcO35685 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NudcO35685 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NudcO35685 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NudcO35685 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NudcO35685 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NudcO35685 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NudcO35685 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NudcO35685 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NudcO35685 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NudcO35685 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NudcO35685 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NudcO35685 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NudcO35685 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NudcO35685 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NudcO35685 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NudcO35685 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NudcO35685 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NudcO35685 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NudcO35685 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NudcO35685 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NudcO35685 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NudcO35685 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NudcO35685 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NudcO35685 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NudcO35685 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
NudcO35685 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NudcO35685 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NudcO35685 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NudcO35685 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NudcO35685 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NudcO35685 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NudcO35685 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NudcO35685 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NudcO35685 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NudcO35685 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NudcO35685 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NudcO35685 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NudcO35685 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NudcO35685 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NudcO35685 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NudcO35685 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NudcO35685 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NudcO35685 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NudcO35685 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NudcO35685 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NudcO35685 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NudcO35685 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NudcO35685 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NudcO35685 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NudcO35685 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NudcO35685 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NudcO35685 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NudcO35685 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NudcO35685 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NudcO35685 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NudcO35685 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NudcO35685 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NudcO35685 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NudcO35685 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NudcO35685 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NudcO35685 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NudcO35685 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NudcO35685 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NudcO35685 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NudcO35685 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NudcO35685 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NudcO35685 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NudcO35685 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NudcO35685 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NudcO35685 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NudcO35685 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NudcO35685 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NudcO35685 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NudcO35685 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NudcO35685 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NudcO35685 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NudcO35685 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NudcO35685 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NudcO35685 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NudcO35685 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NudcO35685 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NudcO35685 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms