Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Opn1mwO35599 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Opn1mwO35599 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Opn1mwO35599 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Opn1mwO35599 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Opn1mwO35599 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Opn1mwO35599 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Opn1mwO35599 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Opn1mwO35599 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Opn1mwO35599 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Opn1mwO35599 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Opn1mwO35599 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Opn1mwO35599 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Opn1mwO35599 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Opn1mwO35599 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Opn1mwO35599 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Opn1mwO35599 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Opn1mwO35599 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Opn1mwO35599 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Opn1mwO35599 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Opn1mwO35599 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Opn1mwO35599 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Opn1mwO35599 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Opn1mwO35599 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Opn1mwO35599 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Opn1mwO35599 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Opn1mwO35599 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Opn1mwO35599 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Opn1mwO35599 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Opn1mwO35599 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Opn1mwO35599 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Opn1mwO35599 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Opn1mwO35599 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Opn1mwO35599 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Opn1mwO35599 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Opn1mwO35599 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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