Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccrl2O35457 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccrl2O35457 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccrl2O35457 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccrl2O35457 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccrl2O35457 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccrl2O35457 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccrl2O35457 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccrl2O35457 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccrl2O35457 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccrl2O35457 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccrl2O35457 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccrl2O35457 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccrl2O35457 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccrl2O35457 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccrl2O35457 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccrl2O35457 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccrl2O35457 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccrl2O35457 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccrl2O35457 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccrl2O35457 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccrl2O35457 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccrl2O35457 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccrl2O35457 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccrl2O35457 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccrl2O35457 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccrl2O35457 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccrl2O35457 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccrl2O35457 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccrl2O35457 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccrl2O35457 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccrl2O35457 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccrl2O35457 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccrl2O35457 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccrl2O35457 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccrl2O35457 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccrl2O35457 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccrl2O35457 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccrl2O35457 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccrl2O35457 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccrl2O35457 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccrl2O35457 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccrl2O35457 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccrl2O35457 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccrl2O35457 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccrl2O35457 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccrl2O35457 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccrl2O35457 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccrl2O35457 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccrl2O35457 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccrl2O35457 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccrl2O35457 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccrl2O35457 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccrl2O35457 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccrl2O35457 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccrl2O35457 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccrl2O35457 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccrl2O35457 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccrl2O35457 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccrl2O35457 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccrl2O35457 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccrl2O35457 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccrl2O35457 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccrl2O35457 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccrl2O35457 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccrl2O35457 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccrl2O35457 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccrl2O35457 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccrl2O35457 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccrl2O35457 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccrl2O35457 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccrl2O35457 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccrl2O35457 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccrl2O35457 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccrl2O35457 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccrl2O35457 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccrl2O35457 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccrl2O35457 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccrl2O35457 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccrl2O35457 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccrl2O35457 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccrl2O35457 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccrl2O35457 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccrl2O35457 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccrl2O35457 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccrl2O35457 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccrl2O35457 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccrl2O35457 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccrl2O35457 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccrl2O35457 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccrl2O35457 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccrl2O35457 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccrl2O35457 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccrl2O35457 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccrl2O35457 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccrl2O35457 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccrl2O35457 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccrl2O35457 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccrl2O35457 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccrl2O35457 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms