Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pkd2O35245 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pkd2O35245 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pkd2O35245 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pkd2O35245 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Pkd2O35245 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Pkd2O35245 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pkd2O35245 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pkd2O35245 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pkd2O35245 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Pkd2O35245 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Pkd2O35245 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pkd2O35245 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pkd2O35245 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pkd2O35245 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pkd2O35245 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pkd2O35245 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pkd2O35245 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pkd2O35245 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pkd2O35245 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pkd2O35245 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pkd2O35245 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pkd2O35245 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pkd2O35245 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pkd2O35245 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pkd2O35245 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Pkd2O35245 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Pkd2O35245 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Pkd2O35245 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Pkd2O35245 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pkd2O35245 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pkd2O35245 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pkd2O35245 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pkd2O35245 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pkd2O35245 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pkd2O35245 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pkd2O35245 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pkd2O35245 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pkd2O35245 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pkd2O35245 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pkd2O35245 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pkd2O35245 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pkd2O35245 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pkd2O35245 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pkd2O35245 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pkd2O35245 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pkd2O35245 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Pkd2O35245 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pkd2O35245 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pkd2O35245 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pkd2O35245 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pkd2O35245 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Pkd2O35245 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pkd2O35245 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pkd2O35245 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pkd2O35245 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Pkd2O35245 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Pkd2O35245 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Pkd2O35245 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Pkd2O35245 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Pkd2O35245 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Pkd2O35245 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pkd2O35245 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pkd2O35245 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Pkd2O35245 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pkd2O35245 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pkd2O35245 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pkd2O35245 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pkd2O35245 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pkd2O35245 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pkd2O35245 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pkd2O35245 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pkd2O35245 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Pkd2O35245 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pkd2O35245 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pkd2O35245 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pkd2O35245 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pkd2O35245 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pkd2O35245 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pkd2O35245 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pkd2O35245 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pkd2O35245 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pkd2O35245 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pkd2O35245 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pkd2O35245 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pkd2O35245 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pkd2O35245 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Pkd2O35245 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pkd2O35245 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pkd2O35245 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pkd2O35245 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pkd2O35245 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pkd2O35245 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pkd2O35245 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pkd2O35245 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pkd2O35245 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pkd2O35245 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pkd2O35245 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pkd2O35245 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Pkd2O35245 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms