Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Polr1aO35134 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Polr1aO35134 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Polr1aO35134 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Polr1aO35134 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
Polr1aO35134 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Polr1aO35134 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Polr1aO35134 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Polr1aO35134 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Polr1aO35134 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Polr1aO35134 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Polr1aO35134 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Polr1aO35134 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Polr1aO35134 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Polr1aO35134 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Polr1aO35134 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Polr1aO35134 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Polr1aO35134 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Polr1aO35134 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Polr1aO35134 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Polr1aO35134 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Polr1aO35134 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Polr1aO35134 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Polr1aO35134 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Polr1aO35134 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Polr1aO35134 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Polr1aO35134 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Polr1aO35134 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Polr1aO35134 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Polr1aO35134 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Polr1aO35134 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Polr1aO35134 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Polr1aO35134 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Polr1aO35134 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Polr1aO35134 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Polr1aO35134 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Polr1aO35134 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Polr1aO35134 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Polr1aO35134 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Polr1aO35134 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Polr1aO35134 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Polr1aO35134 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Polr1aO35134 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Polr1aO35134 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Polr1aO35134 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Polr1aO35134 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Polr1aO35134 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Polr1aO35134 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Polr1aO35134 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Polr1aO35134 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Polr1aO35134 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Polr1aO35134 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Polr1aO35134 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Polr1aO35134 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Polr1aO35134 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Polr1aO35134 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Polr1aO35134 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Polr1aO35134 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Polr1aO35134 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Polr1aO35134 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Polr1aO35134 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Polr1aO35134 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Polr1aO35134 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Polr1aO35134 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Polr1aO35134 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Polr1aO35134 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Polr1aO35134 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Polr1aO35134 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Polr1aO35134 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Polr1aO35134 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Polr1aO35134 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Polr1aO35134 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Polr1aO35134 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Polr1aO35134 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Polr1aO35134 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Polr1aO35134 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Polr1aO35134 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Polr1aO35134 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Polr1aO35134 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Polr1aO35134 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Polr1aO35134 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Polr1aO35134 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Polr1aO35134 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Polr1aO35134 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Polr1aO35134 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Polr1aO35134 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Polr1aO35134 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Polr1aO35134 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Polr1aO35134 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Polr1aO35134 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Polr1aO35134 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Polr1aO35134 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Polr1aO35134 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Polr1aO35134 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Polr1aO35134 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Polr1aO35134 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Polr1aO35134 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Polr1aO35134 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Polr1aO35134 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Polr1aO35134 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms