Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cldn4O35054 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cldn4O35054 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cldn4O35054 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cldn4O35054 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cldn4O35054 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cldn4O35054 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cldn4O35054 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cldn4O35054 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cldn4O35054 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Cldn4O35054 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cldn4O35054 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cldn4O35054 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cldn4O35054 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cldn4O35054 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cldn4O35054 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cldn4O35054 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cldn4O35054 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cldn4O35054 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cldn4O35054 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cldn4O35054 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cldn4O35054 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cldn4O35054 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cldn4O35054 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cldn4O35054 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Cldn4O35054 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cldn4O35054 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cldn4O35054 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cldn4O35054 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cldn4O35054 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cldn4O35054 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cldn4O35054 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cldn4O35054 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Cldn4O35054 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cldn4O35054 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cldn4O35054 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cldn4O35054 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Cldn4O35054 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cldn4O35054 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cldn4O35054 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cldn4O35054 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cldn4O35054 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cldn4O35054 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cldn4O35054 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cldn4O35054 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cldn4O35054 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cldn4O35054 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cldn4O35054 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cldn4O35054 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cldn4O35054 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cldn4O35054 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cldn4O35054 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cldn4O35054 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cldn4O35054 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Cldn4O35054 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cldn4O35054 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cldn4O35054 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cldn4O35054 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cldn4O35054 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cldn4O35054 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cldn4O35054 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cldn4O35054 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cldn4O35054 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Cldn4O35054 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cldn4O35054 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cldn4O35054 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cldn4O35054 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cldn4O35054 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cldn4O35054 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cldn4O35054 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cldn4O35054 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cldn4O35054 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cldn4O35054 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cldn4O35054 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cldn4O35054 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Cldn4O35054 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cldn4O35054 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cldn4O35054 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cldn4O35054 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cldn4O35054 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cldn4O35054 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cldn4O35054 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cldn4O35054 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cldn4O35054 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cldn4O35054 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Cldn4O35054 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cldn4O35054 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cldn4O35054 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cldn4O35054 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cldn4O35054 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cldn4O35054 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Cldn4O35054 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cldn4O35054 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cldn4O35054 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cldn4O35054 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cldn4O35054 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cldn4O35054 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cldn4O35054 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cldn4O35054 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cldn4O35054 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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