Protein–RNA interactions for Protein: O08967

Cyth3, Cytohesin-3, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyth3O08967 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyth3O08967 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyth3O08967 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyth3O08967 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyth3O08967 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyth3O08967 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyth3O08967 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyth3O08967 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyth3O08967 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyth3O08967 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyth3O08967 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyth3O08967 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyth3O08967 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyth3O08967 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyth3O08967 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyth3O08967 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyth3O08967 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyth3O08967 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyth3O08967 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyth3O08967 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyth3O08967 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyth3O08967 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyth3O08967 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyth3O08967 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyth3O08967 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyth3O08967 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyth3O08967 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyth3O08967 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyth3O08967 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyth3O08967 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyth3O08967 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyth3O08967 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyth3O08967 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyth3O08967 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyth3O08967 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyth3O08967 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyth3O08967 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyth3O08967 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyth3O08967 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyth3O08967 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyth3O08967 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyth3O08967 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyth3O08967 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyth3O08967 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyth3O08967 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyth3O08967 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyth3O08967 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyth3O08967 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyth3O08967 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyth3O08967 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyth3O08967 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyth3O08967 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyth3O08967 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyth3O08967 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyth3O08967 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyth3O08967 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyth3O08967 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyth3O08967 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyth3O08967 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyth3O08967 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyth3O08967 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyth3O08967 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyth3O08967 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyth3O08967 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyth3O08967 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyth3O08967 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyth3O08967 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyth3O08967 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyth3O08967 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyth3O08967 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyth3O08967 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyth3O08967 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyth3O08967 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyth3O08967 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyth3O08967 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyth3O08967 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyth3O08967 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyth3O08967 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyth3O08967 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyth3O08967 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyth3O08967 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyth3O08967 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyth3O08967 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyth3O08967 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyth3O08967 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyth3O08967 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cyth3O08967 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyth3O08967 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyth3O08967 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyth3O08967 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyth3O08967 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyth3O08967 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyth3O08967 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyth3O08967 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyth3O08967 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyth3O08967 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyth3O08967 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyth3O08967 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyth3O08967 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyth3O08967 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms