Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gfra2O08842 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gfra2O08842 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gfra2O08842 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gfra2O08842 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gfra2O08842 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gfra2O08842 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gfra2O08842 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gfra2O08842 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gfra2O08842 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gfra2O08842 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gfra2O08842 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gfra2O08842 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gfra2O08842 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gfra2O08842 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gfra2O08842 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gfra2O08842 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gfra2O08842 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gfra2O08842 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gfra2O08842 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gfra2O08842 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gfra2O08842 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gfra2O08842 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gfra2O08842 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gfra2O08842 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gfra2O08842 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gfra2O08842 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gfra2O08842 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gfra2O08842 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gfra2O08842 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gfra2O08842 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gfra2O08842 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gfra2O08842 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gfra2O08842 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gfra2O08842 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21■□□□□ 0.95
Gfra2O08842 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gfra2O08842 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Gfra2O08842 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gfra2O08842 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Gfra2O08842 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gfra2O08842 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gfra2O08842 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gfra2O08842 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gfra2O08842 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gfra2O08842 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gfra2O08842 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gfra2O08842 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gfra2O08842 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gfra2O08842 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gfra2O08842 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gfra2O08842 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gfra2O08842 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gfra2O08842 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gfra2O08842 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gfra2O08842 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gfra2O08842 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gfra2O08842 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gfra2O08842 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gfra2O08842 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Gfra2O08842 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gfra2O08842 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gfra2O08842 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gfra2O08842 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gfra2O08842 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gfra2O08842 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gfra2O08842 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gfra2O08842 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gfra2O08842 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gfra2O08842 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gfra2O08842 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gfra2O08842 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gfra2O08842 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Gfra2O08842 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gfra2O08842 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gfra2O08842 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gfra2O08842 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gfra2O08842 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gfra2O08842 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gfra2O08842 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gfra2O08842 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gfra2O08842 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gfra2O08842 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gfra2O08842 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gfra2O08842 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gfra2O08842 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gfra2O08842 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gfra2O08842 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gfra2O08842 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gfra2O08842 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Gfra2O08842 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gfra2O08842 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gfra2O08842 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gfra2O08842 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gfra2O08842 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gfra2O08842 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gfra2O08842 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gfra2O08842 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gfra2O08842 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gfra2O08842 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gfra2O08842 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms